Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NelfeP19426 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NelfeP19426 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NelfeP19426 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NelfeP19426 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NelfeP19426 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms