Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms