Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sdc1P18828 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sdc1P18828 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sdc1P18828 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sdc1P18828 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sdc1P18828 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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