Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms