Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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PtpraP18052 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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PtpraP18052 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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PtpraP18052 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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PtpraP18052 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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PtpraP18052 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PtpraP18052 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PtpraP18052 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpraP18052 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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PtpraP18052 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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PtpraP18052 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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