Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ass1P16460 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ass1P16460 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ass1P16460 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms