Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp53P15975 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp53P15975 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp53P15975 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp53P15975 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp53P15975 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms