Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms