Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DmdP11531 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DmdP11531 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DmdP11531 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DmdP11531 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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DmdP11531 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DmdP11531 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DmdP11531 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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DmdP11531 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DmdP11531 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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DmdP11531 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DmdP11531 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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DmdP11531 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DmdP11531 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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DmdP11531 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DmdP11531 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DmdP11531 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DmdP11531 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DmdP11531 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DmdP11531 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DmdP11531 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DmdP11531 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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DmdP11531 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DmdP11531 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DmdP11531 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DmdP11531 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DmdP11531 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DmdP11531 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DmdP11531 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DmdP11531 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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