Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
P10404 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
P10404 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
P10404 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P10404 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
P10404 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
P10404 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
P10404 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
P10404 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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