Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms