Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtaP09225 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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