Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb7P09024 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms