Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa5P09021 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms