Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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