Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04213 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04213 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04213 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P04213 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04213 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04213 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04213 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04213 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04213 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04213 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04213 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04213 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04213 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P04213 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P04213 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P04213 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P04213 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P04213 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P04213 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P04213 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P04213 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P04213 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P04213 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P04213 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P04213 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P04213 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P04213 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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