Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53P02340 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53P02340 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms