Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Ab1P01921 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Ab1P01921 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Ab1P01921 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Ab1P01921 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Ab1P01921 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Ab1P01921 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Ab1P01921 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Ab1P01921 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Ab1P01921 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Ab1P01921 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Ab1P01921 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Ab1P01921 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Ab1P01921 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Ab1P01921 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Ab1P01921 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Ab1P01921 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Ab1P01921 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Ab1P01921 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Ab1P01921 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Ab1P01921 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Ab1P01921 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Ab1P01921 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Ab1P01921 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms