Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01797 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01797 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01797 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01797 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01797 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01797 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01797 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01797 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01797 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01797 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01797 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01797 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01797 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01797 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms