Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01734 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
P01734 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01734 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01734 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01734 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01734 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01734 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01734 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01734 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01734 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01734 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01734 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01734 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01734 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01734 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01734 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01734 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01734 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01734 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01734 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01734 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms