Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01678 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01678 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01678 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01678 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01678 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01678 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P01678 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01678 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01678 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01678 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01678 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01678 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01678 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01678 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01678 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P01678 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01678 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01678 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01678 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01678 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01678 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01678 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01678 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01678 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01678 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01678 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01678 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01678 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01678 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01678 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01678 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01678 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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