Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ifnb1P01575 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ifnb1P01575 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ifnb1P01575 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ifnb1P01575 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ifnb1P01575 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ifnb1P01575 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ifnb1P01575 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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