Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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