Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffaO54786 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffaO54786 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffaO54786 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffaO54786 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffaO54786 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffaO54786 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffaO54786 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffaO54786 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DffaO54786 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffaO54786 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffaO54786 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffaO54786 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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DffaO54786 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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DffaO54786 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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DffaO54786 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffaO54786 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffaO54786 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffaO54786 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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DffaO54786 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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DffaO54786 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffaO54786 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffaO54786 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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DffaO54786 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffaO54786 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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DffaO54786 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DffaO54786 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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DffaO54786 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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DffaO54786 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffaO54786 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffaO54786 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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DffaO54786 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffaO54786 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffaO54786 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffaO54786 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffaO54786 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffaO54786 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffaO54786 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffaO54786 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffaO54786 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffaO54786 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffaO54786 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffaO54786 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffaO54786 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffaO54786 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffaO54786 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffaO54786 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffaO54786 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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