Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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