Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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