Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timm44O35857 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timm44O35857 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timm44O35857 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms