Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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