Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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