Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Foxd2O35392 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms