Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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