Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps1O08983 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps1O08983 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms