Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EllO08856 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EllO08856 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms