Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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