Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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