Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Gm379J3QQ19 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Gm379J3QQ19 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Gm379J3QQ19 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gm379J3QQ19 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gm379J3QQ19 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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