Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms