Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm11236J3QMS7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm11236J3QMS7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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