Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20834J3QM72 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms