Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms