Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms