Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r167G3UW71 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Vmn1r167G3UW71 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Vmn1r167G3UW71 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r167G3UW71 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r167G3UW71 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r167G3UW71 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r167G3UW71 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r167G3UW71 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r167G3UW71 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r167G3UW71 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r167G3UW71 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r167G3UW71 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r167G3UW71 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r167G3UW71 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r167G3UW71 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r167G3UW71 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r167G3UW71 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r167G3UW71 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms