Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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H2-M1F7CXU4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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H2-M1F7CXU4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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H2-M1F7CXU4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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