Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms