Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms