Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms