Protein–RNA interactions for Protein: F6RFI0

Gm9887, Predicted gene 9887, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9887F6RFI0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9887F6RFI0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms