Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms