Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms