Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms